1、原料不同

黑茶加工的初级原料是一种中小叶种；普洱茶加工的原料是一种云南大叶种。

2、发酵方式不同

黑茶的加工湿度是鲜叶本身经水分杀青的剩余部分，一般堆温来源于杀青后的残余温度，残存酶促呼吸作用的热量，黑茶特征形成于初制。一般普洱生茶是新鲜的茶叶采摘后，经过杀青、揉捻、毛茶干燥后，以自然的方式进行陈放，是没有经过渥堆发酵处理的茶，而熟茶是生茶经过人工快速后熟发酵，洒水渥堆工序后制成的一种茶品。

3、加工工艺不同

黑茶加工过程中的鲜叶至成品是连续完成的，一般由于原料嫩变的不同，加工时间也有所差别。普洱茶是利用人工调节温度、水分、空气，实现有限控制微生物消长及水热作用，发展出了高温渥堆快速发酵普洱茶的工艺。

4、光化学反应不同

由于黑茶加工的原料是一种中小叶种，内含物质比较低，特别是有效化学成分含量少，也就是咖啡碱、茶多酚、茶多糖等有益成分少，微生物作用时间比较短，有益成分的转化也相对少，同时黑茶原料中的化学成分没有受光的作用，因此没有光化学的参与。

普洱茶则有所不同，因为云南大叶种内含丰富物质，而且普洱茶品质的形成除茶树品种外，会直接受光化学和有益微生物的作用，这也是普洱茶品质形成与黑茶品质形成不同的关键点。