深圳市儿童医院创建于1997年，位于深圳市中心区，是一家集医疗、保健、科研、教学、康复为一体的综合性儿童医院，也是广东省一家三级甲等儿童专科医院。

背倚莲山春早，静观广厦通明，深圳市儿童医院总占地面积约4.3万平方米，建筑面积约17万平方米，开放床位1277张，设有54个临床医技科室，学科设置齐全，涵盖了大型综合儿童医院全部业务科室。2021年门、急诊量260万人次，年出院7.4万人次。

医院先后立项“深圳儿童重症疾病诊断重点实验室”“深圳病原体高通量基因测序技术工程中心”“药物临床试验基地公共服务平台”“免疫系统人源化小鼠模型研发公共服务平台”“深圳小儿血液肿瘤分子医学公共服务平台”等工程载体，引进国内外高水平医学团队11个，其中国际团队2个。同时，医院获得国家药物临床试验机构的资格，获批专业组有：小儿呼吸、小儿神经病学、小儿血液等8个专业组。

医院近年来承担了各级各类重大科研课题项目200余项，包括国家科技部“863”课题、国家自然科学基金重点项目、国家自然科学基金面上及青年项目、国家卫生部卫生行业科研专项重大课题、广东省自然科学基金项目、深圳市科创委重点项目等，纵向科研经费1.3亿余元；近五年发表SCI论文334篇，影响因子（IF>5.0）论文58篇。牵头、执笔及参与制定国际国内指南标准20余部，承办全球学术会议第10届世界儿科感染性疾病大会并发布由我院执笔的《中国儿童合理使用抗菌药物行动计划（2017-2020）》。

深圳市儿童医院是中国医科大学和汕头大学深圳儿科临床学院，南方科技大学和重庆医科大学教学医院，遵义医科大学和锦州医科大学等院校的研究生培养基地。医院拥有儿科和儿外科等国家住院医师规范化培训基地。医院还是深圳市博士后创新实践基地，建成并启用了深圳市儿童医学技能培训部，培养了大批卓越的儿科创新人才。

医院注重人才建设，引进培养了一批具有高学术影响力的学科带头人和学科骨干，涵盖外籍院士，海外高层次人才B类、C类，实用型人才Ⅰ类、Ⅱ类等。截至2021年12月份，医院现有职工2345人，其中博士生导师9名，硕士导师121名、享受国务院特殊津贴者1人、享受深圳市政府津贴者2人、博士102人、硕士582人、高级职称专业人才387人。现有学术团体主任及副主任委员18人、学组组长及副组长15人，常委27人、委员271人，中华医学会、中华预防医学会、中华口腔医学会、中华中医药学会各专业组委员76人。