1、外形不同

馒头是中国汉族传统面食之一，一种用面粉发酵蒸成的食品，成品外形为半球形或长方形。本有馅，后称无馅的为馒头，有馅的为包子，通常人们选择馒头来作为主食。

花卷是一种古老的汉族面食，营养丰富，味道鲜美，做法简单。制作时，往往会将面制成薄片拌好作料后，卷成半球状，里面有夹心，与馒头外形有很大差异。

2、掺入物不同

最初的馒头并没有掺入物，但随着历史的发展，逐渐会掺入肉、蔬菜、豆蓉、糖等等掺入物。而花卷除了可能会掺入以上物质外，还要掺入椒盐、麻酱、葱油等各种口味的香料，因此其口味更好，热量更高，油脂多。