中成药的命名方式基本沿袭了传统方剂的命名法，即每种中药材，中药饮片及中药提取物职称的中成药命名，都由体现方药特征与表示剂型的两部分组成。由于中成药的历史悠久，方药特征多种多样，复杂繁多，制方命名的人则往往从各自的角度出发，因而中成药的命名方式是多元的。

1、以方剂的来源命名

根据处方原再书籍命名，可知其来源出处，如局方牛黄清心丸（《源于太平惠民和剂局方》），金匮肾气丸（源于张仲景《金匮要略》）。

2、以处方组成命名

以组成药物味数命名，如六味地黄丸由地黄为主的六位药物组成，二冬膏由天门冬和麦冬二药组成，处方简单，则直书组成药物，如磁朱丸，板蓝根颗粒、银黄口服液等；以主药名称命名，如良附丸、参芪丸、丁桂散等、以组成药物配比命名。如六一散，有滑石6份、甘草1份组成。

3、以中成药的功效命名

如理中丸指其有调理中焦之功。养血安神糖浆指其有养血安神之效。

4、以处方组成和功效命名

取主药和功效同用，如银翘解毒片以金银花、连翘为主要，具有散风解表之功；艾附暖宫丸以艾叶、香附为主药，有暖胞宫作用。

5、以中成药的性状命名

如云南白药为白色粉末；紫雪丹形如霜雪而色紫。

6、以所治疾病命名

如白带丸、流感茶、风湿骨痛酒、小儿惊风散等，为方便临床使用及患者选择，大量新研制药多直接采用治疗病症命名。

7、以中成药的主要成分命名

如绞股蓝总苷胶囊、绞股蓝总苷片等。

8、以炮制方法、服用方法、服用剂量命名

服用剂量命名的如十滴水、九分散，是指一次服用的常用量，并提醒患者注意用量，常含有剧毒成分；炮制方法命名的如十灰散、九制大黄丸等。以药物服用方法命名的如珠黄吹喉散、川芎茶调散等。