1、清热燥湿

黄连性寒，味苦。黄连可用于治疗咽喉肿痛、燥热、风湿痹痛等病症，黄连之苦，可导心下之虚热，去中焦湿热而泻心火，若脾胃气虚，不能运转，则以茯苓、黄芩代替。

2、抗菌消炎

黄连含有大量小檗碱，这种物质对革蓝氏阳性、革蓝氏阴性等细菌有抑制作用，因此黄连是一种广谱抗菌的中草药，对于细菌引起的痢疾等疾病有一定的治疗效果。

3、泻五脏火

若目赤肿痛，则是肝之邪热。打嗝恶心、吞吐酸苦，则是脾之邪热。胁肋胀满、灼热、心下痞满，则是肝脾的邪热。口舌生疮、有口气、唇齿燥裂，则是心脾的邪热，这些都属于火热内盛，阳盛阴衰，用黄连则可治之。

4、止痢止泻

止痢止泻宜用辛苦寒药，辛能发散，开通郁结，苦能燥湿，寒能胜热，使气宣平。一般的苦寒药都导致腹泻，但黄连性冷而燥，能降火祛湿，从而止痢，治疗邪热导致的拉肚子现象。

5、清胃止呕

黄连可用于治疗胃火炽盛所致的多种病症，例如胃热导致的呕吐、牙龈红肿、出血等症状，常配以石膏、升麻等药同用。若有消渴证，可配麦冬一起食用。