北京同仁堂和南京同仁堂都是中国著名的中药企业，起源于清朝同治年间的北京同仁堂。两家企业的主要区别如下：
企业历史：北京同仁堂创立于1669年，是中国古老的中药企业之一，南京同仁堂则于1926年在江苏南京创立。
企业规模：北京同仁堂是国有大型企业，拥有着庞大的销售网络和多家子公司，产品涵盖中药、西药、保健品等多个领域。南京同仁堂则规模较小，主要集中于中药领域。
产品特色：北京同仁堂以传统中药为主要产品线，主要以方剂制剂、中成药、保健品等为主，涵盖了中西医结合的多个领域。南京同仁堂则以传统中药为主，主要涉及中药材、中药制剂等方面。
地域影响：北京同仁堂作为中国中医药的发源地和中药产业的重要基地，在中国乃至国际中药市场上具有广泛的知名度和影响力。南京同仁堂则主要在江苏和周边地区拥有一定的知名度和市场份额。
