1、作用层次不同
水疗素作用于头发的第二层——毛皮质，解决头发枯黄、细弱、易断、分叉等问题。它的作用是补充毛皮质内部的营养，并修复受损部位。
发膜作用于头发的第三层（最里层）——毛髓质，解决头发细弱易断、极度干枯、大面积分叉、蒲公英发质等问题。它的作用是深层滋养头发，将营养物质送达发芯最里层。
2、使用方法不同
水疗素的话一般的做法是洗完发之后擦干，再将其涂到头发上，找个可以躺下的地方，把头发泡在水中，大概15-20分钟。
发膜的话是没有泡在水中的这个过程的，一般做法就是将头发洗净然后均匀涂抹然后用保鲜膜或者浴帽将头发包裹起来，这样做能防止头皮表层热气散失过快，因为较高的温度，有利于头发吸收营养。5-10分钟后，先用少量水将发膜乳化，再彻底清洗干净。
3、使用频率不同
水疗素是不能常用的，一个月用一两次就可以了。而发膜的使用频率就高得多，一周可以用2-3次。
