1、存储方式：传统档案管理方法主要依赖于纸质文档的存储，需要专门的物理空间来容纳大量文件和文件柜。而档案管理系统采用数字化存储方式，将档案转换为电子文件，可以在电脑或服务器上进行存储，减少了对实体空间的需求。

2、检索效率：在传统档案管理中，需要手动查找和浏览纸质文件以获取所需信息，这可能会耗费大量时间和精力。而档案管理系统通过全文搜索、关键词检索等功能，能够快速定位和获取所需档案信息，大大提高了检索的效率和准确性。

3、安全性与保密性：传统档案管理方法对于档案的安全性和保密性控制较为困难。纸质档案容易受到物理损坏、灾害和非授权访问的威胁。而档案管理系统通过权限控制、电子签名和审批流程等功能，可以对档案信息进行严格的安全管理和保密控制。

4、协同工作与共享：在传统档案管理中，不同部门或分支机构之间共享和协同工作的效率较低。需要通过复制、传递纸质文件或者依赖邮件、传真等方式进行沟通。而档案管理系统提供了多用户协同工作的功能，不同人员可以同时访问和处理档案，实现了更高效的协作和信息共享。

5、档案保护与灾备：传统档案管理方法对于档案的保护和灾备计划相对薄弱。纸质档案容易受到火灾、水灾等自然灾害的破坏，且难以进行完备的备份和恢复。而档案管理系统可以进行定期的数据备份和灾备措施，确保档案信息的安全性和可靠性。